从 44 万个"幽灵"说起：基于Rust开发的OntoDB 把关系、图、向量、本体等多模态数据融进一个内核，与一次 HNSW 召回坍塌的完整排查

内容摘要

• OntoDB 将关系、图、向量、本体等 12 种数据模型统一到基于 LSM-Tree 的存储内核，并共享 WAL、compaction、事务边界与块缓存。 • 一次针对 227 万条化合物指纹的 HNSW 排查发现召回率随 k 增大反而下降；问题涉及边界条件、内存状态快照缺失及数据失败链。 • 修复后，id-recall@10 从 0.844 提升至 0.9784，dist-recall@10 为 0.9964，图节点数与 SQL 侧精确对齐至 1,638,397。 • 系统提供统一查询语言 OntoQL、混合查询优化、事务内多模态写入、CDC 与 SUBSCRIBE，并支持 PostgreSQL、MySQL 和 HTTP REST 协议接入。 文章围绕 OntoDB 的多模态统一架构，详述一次由 HNSW 召回倒挂暴露并修复的数据一致性问题。